冷冻电镜前沿技术与发展应用
宋芸1,左沁宇2,蒙学明2,李光一1,魏宇宇1,段佳琳1,辛立辉1,丛尧2,3,孔亮亮1(1 中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究(上海)设施; 2 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,上海生物化学与细胞生物学研究所,核糖核酸功能与应用全国重点实验室,中国科学院大学;3 国科大杭州高等研究院生命与健康科学学院,中国科学院大学,浙江省系统健康科学重点实验室)
摘要:随着冷冻电镜(Cryo-EM)分辨率革命的到来,冷冻电镜技术已成为生物大分子结构解析的核心手段。这场技术革命的背后,是多维度技术的协同发展。新兴的冷冻制样技术,尤其是亲和载网及时间分辨率的冷冻制样技术,不仅具有整合生物复合体提纯与冷冻制样、降低气- 液界面影响的潜能,还有望捕捉生物过程的瞬时构象。冷冻聚焦离子束减薄结合荧光定位与高压冷冻技术,可实现对细胞或组织样品的精准减薄,助力揭示细胞原位中的“分子社会”及生物过程的时空调控。冷冻透射电镜硬件、控制软件及探测器的不断发展,极大推进了高通量、高分辨率、自动化的电镜数据采集。近年来,人工智能(AI) 与冷冻电镜技术的深度融合,正在推进冷冻电镜技术向着捕获生物大分子动态生物过程,揭示其原位时空调控和“分子社会关系”方向飞速发展,为揭示生命本质提供了强大的技术支撑。冷冻电镜技术不仅在基础研究中具有重要意义,在药物开发等应用领域也展现出巨大潜力。本文将围绕冷冻样品制备、冷冻透射电镜及探测器硬件数据收集及AI 应用等方向展开阐述。
关键词:冷冻制样技术;冷冻透射电镜及探测器;电镜数据采集;人工智能
目录介绍
1 冷冻电镜制样前沿技术
1.1 亲和载网(affinity grid)制样方法
1.2 时间分辨率的冷冻制样技术
1.3 冷冻聚焦离子束(cryo-focused ion beam, Cryo-FIB)减薄技术
1.4 高压冷冻(high pressure freezing, HPF)制样技术
2 高端冷冻透射电镜的配置及特色
2.1 Titan Krios系列冷冻电镜
2.2 JEOL Cryo-ARM 300系列电镜
3 直接电子探测器(direct electron detectors, DED)
4 冷冻电镜数据收集
4.1 冷冻电镜自动化数据收集软件
4.2 冷冻电镜数据收集的提速
5 AI在冷冻电镜领域的应用
6 展望
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