位点特异性糖基化蛋白质组学研究回顾与展望
陈乐晗1, 刘佳林1, 曹纬倩1,2 (1.复旦大学附属上海市第五人民医院和生物医学研究院;2.国家卫生健康委员会糖缀合物重点实验室)
摘要:糖基化是蛋白质翻译后修饰中最为多样和复杂的类型之一, 具有广泛且重要的生物学功能. 作为研究蛋白质糖基化修饰的核心领域, 糖蛋白质组学, 尤其是位点特异性糖基化蛋白质组学研究, 能够揭示与疾病相关的糖链结构和糖基化位点. 这不仅有助于深入理解特定蛋白质糖基化修饰特征, 还为揭示糖基化在疾病发生和发展中的作用机制提供了重要的信息. 本综述回顾了过去20年基于质谱的糖蛋白质组学的主要进展, 重点聚焦于完整糖肽解析的研究成果. 首先, 概述了糖蛋白质组学的发展历程, 并回顾了从糖基化位点鉴定到完整糖肽解析中的关键研究进展. 随后, 深入探讨了糖肽富集技术、质谱分析方法、数据解析工具及数据库建设等方面的进展, 分析了相关技术的优势与挑战. 最后, 指出了当前糖蛋白质组学研究中亟需解决的问题, 并展望了未来在解析深度、全面性、准确性及生物医学应用等方面的发展方向.
关键词:糖蛋白质组学, 位点特异性糖基化解析, 完整糖肽鉴定和定量, 质谱分析
目录介绍
1 从糖基化位点鉴定到完整糖肽解析
2 糖肽富集技术进展
3 质谱分析与谱图解析技术
3.1 糖肽在质谱中的碎裂
3.2 质谱数据解析策略和工具的发展
4 数据库及数据挖掘工具
4.1 糖链数据库
4.2 含修饰位点的糖链库和数据挖掘工具
5 总结与展望
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