环状多肽在药物研发方面的进展

曾庆1, 代博涛1, 姜和明2, 徐慧东1, 吴云东1,2,3（1.北京大学深圳研究生院化学生物学与生物技术学院；2.深圳湾实验室化学生物学研究所；3.北京大学化学与分子工程学院）

摘要：环肽分子因其稳定性、膜通透性和高亲和力等独特优势, 已成为多肽药物市场的重要组成部分, 在新药研发领域展现出广泛的应用潜力. 近年来, 为满足新药研发中高通量筛选的需求, 并针对环肽药物中多样的成环方式、修饰策略和非天然氨基酸引入等特点, 一系列新型合成方法被开发出来. 同时, 适用于环肽体系的计算方法也日趋完善, 显著提升了环肽药物的开发效率并拓展了化学空间. 本文系统综述了: (1) 具有代表性的环肽合成方法研究进展; (2) 新兴的计算设计方法, 包括不同结构单元和成环方式的稳定构象预测与从头生成方法、构象系综预测方法以及环肽成药性质相关数据集和预测工具的发展情况; (3) 结合计算与实验工具研发环肽药物分子的典型案例, 如单稳定构象环肽和透膜环肽的设计等. 最后, 本文展望了机器学习技术在环肽药物发现中可能的应用前景.

关键词：环肽药物, 环肽合成, 结构预测, 构象生成, 环肽设计